古代 DNA 的前景在于其信息承载能力。存储在 DNA 中的模式可以告诉我们古代原始人的生活、他们那个时代的人口动态，以及现代人类是如何形成的。但是，从这些风化样本中提取这些信息并非易事。这不仅在技术上具有挑战性，而且提取 DNA 的过程是破坏性的，这意味着这些珍贵的文物即使不是彻底销毁，也必须被破坏。因此，在处理古代 DNA 时，对错误的容忍度很小——即使是很小的低效率也会造成无法弥补的损失。由于风险如此之高，研究人员能够获得最适合这项工作的工具至关重要。...

在不到十年的时间里，CRISPR-Cas 系统已成为功能基因组学筛选中不可或缺的一部分。通过不断扩展的 CRISPR 工具包，研究人员可以剖析复杂的基因-表型关系并更深入地研究疾病过程，从而有可能在此过程中发现新的治疗靶点。然而，越来越明显的是，基因在动态网络中运作，其中冗余、协同和拮抗基因协同产生强大的表型。识别网络任何基因功能的尝试可能会因其补偿和维持体内平衡的能力而受挫。因此，绘制基因网络的结构图仍然是一个相当大的挑战，这极大地限制了我们对临床相关过程（如恶性转化、耐药性发展和细胞可塑性）的理解。 为了克服这一挑战，纽约大学和纽约基因组中心的研究人员开发了 Cas13 RNA Perturb-seq （CaRPool-seq），这是一种新的 CRISPR 筛选方法，它利用单细胞测序和组合扰动策略（在每个细胞内同时操纵多个基因）。实际上，CaRPool-seq 允许研究人员开始解开基因网络及其支持的过程。...

以下是 Twist 为《基因工程新闻》编写的电子书的摘录：《CRISPR 筛选的变化格局：最新 CRISPR 筛选方法和技术指南》。您可以在此处下载完整的电子书。 即使对于经验丰富的研究人员来说，设计 sgRNA 文库也可能是一项艰巨的任务。数千个文库中的每个指南都需要仔细考虑，以确保其靶基因的保真度。而且，准确性并不总是等同于有效性——大约 20% 的 CRISPR 诱变会导致框内突变，其中许多突变不太可能影响蛋白质功能1.自 CRISPR 首次应用于哺乳动物细胞的基因编辑以来的十年中，设计 sgRNA 文库的指南不断发展，以应对新的见解和新技术。随着这种演变，对定制 CRISPR sgRNA 文库的需求不断增长，这些文库经过定制，旨在最大限度地提高效率，同时充分利用 CRISPR 筛选的发现能力。 在这里，我们与 Twist 的两位 CRISPR 专家坐下来讨论 sgRNA 文库设计的基础知识，以及他们对考虑定制方法的人有什么建议。Julian Jude 博士是著名的 CRISPR 专家，也是用于对 sgRNA 设计进行评分的维也纳生物活...

原英文链接：https://www.twistbioscience.com/cn/blog/science/IVDR 从植入物到NGS：IVDR的过去、现在与未来 一个穿着手术服、戴着口罩的人正在给另一个人的手臂上绑绷带。 尽管我们将在这篇文章中探讨临床下一代测序（NGS）产品的监管，但首先谈谈乳房植入物是必要的。在1990年到2010年之间，Poly Implant Prothèse（PIP）公司生产了超过两百万的植入物。许多植入物被给予那些希望重新拥有癌症夺走的身体的患者。其他人则将植入物视为一种化妆品，一种类似于新纹身的自我表达形式。虽然他们的理由各不相同，但他们都有一个共同的信任，即PIP植入物是安全的。很少有人，如果有人的话，预料到随之而来的慢性疼痛、精神痛苦和医疗不确定性。 2010年，PIP乳房植入物的丑闻爆发，当不良事件的报道促使法国药品和健康产品安全局（Agence Nationale De Sécurité Du Médicament Et Des Produits De Santé）召回该公司的产品（随后有几个其他国家跟进）。累积的证据显示，这些植入物的破裂率是预期的...

原英文链接：https://www.twistbioscience.com/cn/blog/science/cfDNA-library-preparation-kit 什么是ctDNA检测的关键？ 良好的准备 Twist cfDNA文库制备试剂盒能够进行敏感的ctDNA研究 数字渲染的三个半透明的绿色DNA螺旋，背景为深蓝绿色 DNA的小片段可以讲述重要的故事，特别是当它们来源于癌细胞时。通过血液中游荡的DNA片段携带的突变可能暴露出一种新生的肿瘤，这种肿瘤正生长在常规检测极限之外。此外，在游离细胞DNA中发现的其他突变可以告诉人们一个正在发展治疗抗性的肿瘤。自然地，循环肿瘤DNA（ctDNA）及其所包含的信息已成为临床生物标志物的一个有前景的来源，其在早期癌症检测、治疗指导和最小残留病测试中的应用日益增多。 然而，ctDNA的难以捉摸的特性使其极难获取。用于液体活检的血液血浆、尿液和其他体液中充满了从全身健康组织释放的游离细胞DNA（cfDNA）。在这个遗传环境中，只有大约0.01%到10%的总cfDNA片段可能被识别为肿瘤来源。此外，并不总是清楚ctDNA会是什么样子：肿瘤相关的突变可能发生...